امام خميني در موارد مختلف، انديشه فقاهتي و حضور مدبّرانه و آگاهانه آيت الله العظمي صافي را در بطن مسائل مهم جاري، ارج نهادند و از همين روي ايشان را به ايفاي نقش در شوراي نگهبان كه در آن زمان مهم ترين و آخرين مركز تصميم گيري درباره تأييد قوانين كشور و مطابقت آن با شرع و قانون، محسوب مي گشت برگزيدند.
امام خميني در نامه مورخ 22 / 3 / 65 خود به شوراي نگهبان، آيت الله العظمي صافي را از «فقها» يي دانسته اند كه «لياقت و تعهدشان محرزست» و «در مدت طولاني خدمت، آشنايي وافر به مسائل جاريه دادند».
و در جايي ديگر، درباره ايشان فرموده اند:
«معظم له مورد علاقه اينجانب هستند.»